W roku 1958 powołano w Szczecinie Międzyszkolny Klub Sportowy Kusy, który na początku był dwusekcyjny. Trenowano wówczas piłkę ręczną i gimnastykę sportową. Nazwę zaczerpnięto od pseudonimu wybitnego lekkoatlety, Janusza Kusocińskiego.
Po dwudziestu latach istnienia klubu rozszerzono go o kolejną sekcję – siatkówkę dziewcząt. Kolejne lata przyniosły powstanie zespołu koszykówki, lekkoatletyki, tenisa stołowego, szachów, czy szermierki. W międzyczasie klub został przejęty przez Międzyszkolny Ośrodek Sportowy. Od 1992 roku jest samodzielną jednostką organizacyjną po tym, jak został wpisany do rejestru kultury fizycznej. Przez lata świetnie wykonywanej pracy, MKS Kusy zyskał miano jednej z najlepszej drużyn młodzieżowych w Polsce.
Nazwę zaczerpnięto od pseudonimu Janusza Kusocińskiego. Popularny „Kusy” był jednym z najwybitniejszych polskich lekkoatletów przedwojennej Polski. Urodzony w 1907 roku w Warszawie zawodnik był wielokrotnym mistrzem Polski w biegach długodystansowych i średnich. Miał na swoim koncie wielkie osiągnięcia na arenie międzynarodowej. W 1932 roku zdobył złoty medal w biegu na dziesięć kilometrów na Igrzyskach Olimpijskich w Los Angeles. Dwa lata później w Turynie zorganizowano po raz pierwszy Mistrzostwa Europy w biegu na 5000m, gdzie Kusociński zajął drugie miejsce i odebrał srebrny medal. Zginął rozstrzelany przez Niemców w 1940 roku w ramach akcji mającej na celu eksterminację polskiej inteligencji.
Dlaczego zatem szczeciński klub przyjął nazwę na jego cześć? Lekkoatleta był wzorem odwagi, niezłomności i czystości sportu. Takie wartości były i są najważniejsze dla MKS Kusy.
